En del af forskningen ved Ribe Kunstmuseum foregår i tæt samarbejde med andre institutioner eller selvstændige fagfolk med interesse for museets ansvarsområde, ligesom Ribe Kunstmuseum undertiden fungerer som moderinstitution for eksterne forskningsprojekter. Fra 2011 indgår Ribe Kunstmuseum i et formaliseret samarbejde med kunstmuseet Fuglsang på Lolland med henblik på bl.a. forskning, idet begge museer – i hver sin del af landet – har guldalderen og dens tilstødende perioder som et primært ansvarsområde.